理化学研究所(理研)岩崎RNAシステム生化学研究室の岩崎信太郎主任研究員、水戸麻理テクニカルスタッフらの共同研究グループ ※ は、エピジェネティクス[1] 制御に必須な役割を果たすヒストン修飾[2] を細胞種特異的に解析する新手法を開発しました。
クロマチン免疫沈降法(ChIP)に続いて次世代型の高処理能装置でタグ配列解読を行う方法(ChIP-seq)は、転写調節因子結合部位およびクロマチン修飾部位のマッピングに適した方法として、クロマチン免疫沈降法に続いてゲノムタイリングアレイ解析を行う ...
臨床病理検体で通常行われる組織固定の際に広く導入される架橋結合は、アーカイブ化された組織標本をChIP-seq法(chromatin immunoprecipitation followed by next-generation sequencing:クロマチン免疫沈降・塩基配列解読法)によって解析する際の大きな妨げとなっていて ...
理化学研究所(理研)生命医科学研究センタートランスクリプトーム研究チームのアレッサンドロ・ボネッティ客員研究員、ピエロ・カルニンチチームリーダーらの研究チームは、細胞核内のRNAとゲノムDNA(クロマチン[1] )の相互作用をゲノム全体で調べる ...
Figure 1: RNA-seq data uses short reads of mRNA which is free of intronic non-coding DNA. These reads must then be aligned back to the reference genome. Credit: Technology Networks. Early RNA-seq ...
Next-generation RNA sequencing has transformed molecular profiling for clinical research, but formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) samples continue to present significant challenges. Traditional ...
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