研究室で遺伝子配列を扱うとき、「この配列からこの部分だけ取り出したい」「相補鎖に変換したい」「複数の配列をまとめて処理したい」といった作業に悩んだことはありませんか？ 市販の解析ソフトを使えば簡単ですが、高額なライセンス料がネックに ...

塩基配列中に改行が入ったFASTAファイルを2行単位のFASTAファイルに変換するシェルスクリプトです。Linux環境で動きます。 アセンブルしたデータやオンラインデータベースからダウンロードしたFASTAファイルは、配列中に改行が入っていることがしばしばです。